iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation）技术是由美国应用生物系统公司ABI 研发的一种多肽体外标记技术。

SILAC的是分别用天然同位素(轻型)或稳定同位素(重型)标记的必需氨基酸取代细胞培养基中相应氨基酸，细胞经5-6个倍增周期后，稳定同位素的氨基酸完全掺入到细胞新合成的蛋白质中替代了原有氨基酸。不同标记细胞的裂解蛋白按细胞数或蛋白量等比例混合，经分离、纯化后进行质谱鉴定。

Label free是—蛋白质非标记标记技术越来越受到关注，它克服了传统的同位素标记的缺点，即过高的样品浓度, 复杂的实验方案及价格过高的原料等，该方法具有速度更快，更简洁及更简明的结果等优点，大有取代同位素标记技术。

SWATH技术具有灵敏度高，重现性强，准确度高，高通量，线性动态范围大等优点。

蛋白质经过蛋白酶的酶切消化后成肽段混合物，在质谱仪中肽段混合物电离形成带电离子，质谱分析器的电场、磁场将具有特定质量与电荷比值（即质荷比，M/Z）的肽段离子分离开来，经过检测器收集分离的离子，确定每个离子的M/Z值。经过质量分析器可分析出每个肽段的M/Z，得到蛋白质所有肽段的M/Z图谱，即蛋白质的一级质谱峰图。